当您在淘宝申请退款后，发现卖家已经发货，您可以采取以下步骤：
及时联系卖家
登录淘宝App，进入“我的淘宝”页面，找到相关交易，点击对应的“退款”按钮，操作申请退款。
如果卖家对退款申请有异议，可以点击拒绝退款申请，输入拒绝理由，完成拒绝退款申请操作。拒绝退款申请后，退款状态变更为卖家不同意协议，等待买家修改。此时，您可以与卖家进行友好协商，如果最终无法达成一致，淘宝小二将会介入进行处理。
选择退货方式
如果您选择退货，可以与卖家协商退货方式，包括退货时间、快递公司等。一般情况下，卖家会要求您将商品寄回，并承担退货运费。您可以要求卖家承担运费，或者协商由您支付运费后退货。
如果卖家已经发货且您希望保留商品，可以与卖家沟通，并向其支付相应金额，然后重新购买该商品。
拒收货物
如果您已经收到货物，但决定不保留，可以选择拒收。在收到货物后，直接拒签，并联系卖家告知其已拒收货物，要求卖家联系快递公司将货物退回。
如果货物已经到达您所在地点但您忘记拒收，您应该尽快联系快递公司，说明情况并要求退回货物。如果快递公司无法联系到您，您可以尝试联系卖家，提供快递单号等信息，要求卖家协助处理。
确认退款
在卖家收到退货并确认无误后，卖家会处理退款事宜，退款金额会在相应时间内返还到您的支付宝账户中。
保留证据
在整个过程中，建议您保留所有相关证据，包括聊天记录、快递单号、退货凭证等，以便在出现问题时能够提供证明。
通过以上步骤，您应该能够顺利处理淘宝退款已发货的情况。如果遇到任何问题，建议及时与卖家或淘宝客服联系，以便尽快解决问题。
